中医科是上海蓝十字脑科医院的优先发展学科，对于常见疾病、多发疾病，各种脑血管疾病及其后遗症等所致的偏瘫、脊髓损伤、昏迷等，以中医四诊为基础，施以传统的针灸、推拿、艾灸、拔罐、穴位注射、杵针、耳穴、放血、方药等内外治法，结合现代诊疗手段，充分发挥中医的特色。
尤其是利用中药，体针、头针与功能锻炼相结合的方法在治疗中风偏瘫上成效显著，形成了以中医康复为鲜明特色的专科优势，因其毒副作用少，深受患者欢迎。
其中“脑梗古法诊治术”是上海市闵行区第十批非物质文化遗产代表性项目，源于2000多年来历代名医对脑病的理论和方剂研究之精华，守正创新形成的一套针对脑梗死疾病行之有效的诊疗和预防方法。其精髓在于“古法”，核心要义是“针药结合”，创新点在于“一针透多穴”的运用、平刺或斜刺的技艺，一针能使多个穴道、多条经络打通，同时把现代高科技术“红外热成像仪”用于临床，对当前数以万计脑梗患者的治疗康复及潜在患者的提前干预，切实改善该患者群体的生活质量，降低死亡率、重病率。
